Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TMUB2Q71RG4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMUB2Q71RG4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms