Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
UBR3Q6ZT12 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
UBR3Q6ZT12 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
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