Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RBM43Q6ZSC3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RBM43Q6ZSC3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms