Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00299Q6ZSB3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00299Q6ZSB3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms