Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC129Q6ZRS4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC129Q6ZRS4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC129Q6ZRS4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms