Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC73Q6ZRK6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms