Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SHISA2Q6UWI4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SHISA2Q6UWI4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms