Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRSAM1Q6UWE0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRSAM1Q6UWE0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms