Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNT2Q6UVM3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNT2Q6UVM3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms