Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S1

DENND1B, DENN domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1BQ6P3S1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DENND1BQ6P3S1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms