Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAVIN1Q6NZI2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAVIN1Q6NZI2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms