Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD54Q6NXT1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ANKRD54Q6NXT1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms