Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC70Q6NSX1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC70Q6NSX1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms