Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CARMIL2Q6F5E8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CARMIL2Q6F5E8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms