Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCTP1Q6DN14 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCTP1Q6DN14 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms