Protein–RNA interactions for Protein: Q6DKI2

LGALS9C, Galectin-9C, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS9CQ6DKI2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LGALS9CQ6DKI2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms