Protein–RNA interactions for Protein: Q6A163

KRT39, Keratin, type I cytoskeletal 39, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT39Q6A163 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KRT39Q6A163 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KRT39Q6A163 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms