Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TNS3Q68CZ2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNS3Q68CZ2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms