Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LARP1BQ659C4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms