Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ECM29Q5VYK3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ECM29Q5VYK3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms