Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SUSD4Q5VX71 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SUSD4Q5VX71 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms