Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LRCH2Q5VUJ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LRCH2Q5VUJ6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms