Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C9orf135Q5VTT2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms