Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC183Q5T5S1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC183Q5T5S1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms