Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NHSL1Q5SYE7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NHSL1Q5SYE7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NHSL1Q5SYE7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms