Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BRMS1LQ5PSV4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRMS1LQ5PSV4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms