Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A3Q5K4L6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A3Q5K4L6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms