Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HERC4Q5GLZ8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms