Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN4Q5BKX8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CAVIN4Q5BKX8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms