Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RPL39P5Q59GN2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms