Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SFT2D3Q587I9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SFT2D3Q587I9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms