Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TTLL9Q3SXZ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TTLL9Q3SXZ7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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