Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
KRTAP20-2Q3LI61 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms