Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTC1Q2NKJ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CTC1Q2NKJ3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms