Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ISXQ2M1V0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms