Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SWI5Q1ZZU3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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