Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MSMPQ1L6U9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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