Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SGCBQ16585 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SGCBQ16585 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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