Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SNRNP35Q16560 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRNP35Q16560 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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