Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GRIK4Q16099 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GRIK4Q16099 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms