Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZIC1Q15915 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZIC1Q15915 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms