Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
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