Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
ATP6AP1Q15904 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
ATP6AP1Q15904 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
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