Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
RYR3Q15413 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
RYR3Q15413 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms