Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SF3B3Q15393 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SF3B3Q15393 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SF3B3Q15393 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
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