Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NECTIN1Q15223 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
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