Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
R3HDM1Q15032 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
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