Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COL19A1Q14993 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL19A1Q14993 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL19A1Q14993 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COL19A1Q14993 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COL19A1Q14993 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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COL19A1Q14993 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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COL19A1Q14993 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COL19A1Q14993 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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