Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CTTNQ14247 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CTTNQ14247 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms