Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBE4AQ14139 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBE4AQ14139 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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